Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms