Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C1orf50Q9BV19 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms