Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LPIN3Q9BQK8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms