Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms