Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP88Q99567 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP88Q99567 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP88Q99567 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP88Q99567 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP88Q99567 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms