Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EYA3Q99504 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms