Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms