Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALS2CR12Q96Q35 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms