Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms