Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCHS1Q96JQ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCHS1Q96JQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms