Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms