Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF4BQ92750 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms