Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGDCC3Q8IVU1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms