Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms