Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPTE2Q6XPS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms