Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LETMD1Q6P1Q0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms