Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms