Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NANOGP8Q6NSW7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NANOGP8Q6NSW7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms