Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FREM1Q5H8C1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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