Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms