Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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