Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL9A2Q14055 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL9A2Q14055 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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