Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP1Q13835 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP1Q13835 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP1Q13835 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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