Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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TCIRG1Q13488 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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