Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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