Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE3BQ13370 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE3BQ13370 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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