Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms