Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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