Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms