Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms