Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms