Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms