Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms