Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms