Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata5P97489 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata5P97489 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata5P97489 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata5P97489 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms