Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRCA2P51587 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms