Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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