Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETV1P50549 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms