Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms