Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms