Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms