Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMPK1P30085 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms