Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms