Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms