Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LOXP28300 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXP28300 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXP28300 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXP28300 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LOXP28300 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LOXP28300 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms