Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms