Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PLNP26678 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms