Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMLP26374 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMLP26374 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms