Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GADD45AP24522 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms