Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN1P12814 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms